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pybind11和numpy进行交互的方法

更新时间:2020-07-11 04:00:02 作者:startmvc
使用一个遵循bufferprotocol的对象就可以和numpy交互了.这个buffer_protocol要有哪些东西呢?要

使用一个遵循buffer protocol的对象就可以和numpy交互了.

这个buffer_protocol要有哪些东西呢? 要有如下接口:


struct buffer_info {
 void *ptr;
 ssize_t itemsize;
 std::string format;
 ssize_t ndim;
 std::vector<ssize_t> shape;
 std::vector<ssize_t> strides;
};

其实就是一个指向数组的指针+各个维度的信息就可以了. 然后我们就可以用指针+偏移来访问数字中的任意位置上的数字了.

下面是一个可以跑的例子:


#include <pybind11/pybind11.h>
 #include <pybind11/numpy.h>
 namespace py = pybind11;
 py::array_t<double> add_arrays(py::array_t<double> input1, py::array_t<double> input2) {
 py::buffer_info buf1 = input1.request(), buf2 = input2.request();
 if (buf1.ndim != 1 || buf2.ndim != 1)
 throw std::runtime_error("Number of dimensions must be one");
 if (buf1.size != buf2.size)
 throw std::runtime_error("Input shapes must match");
 /* No pointer is passed, so NumPy will allocate the buffer */
 auto result = py::array_t<double>(buf1.size);
 py::buffer_info buf3 = result.request();
 double *ptr1 = (double *) buf1.ptr,
 *ptr2 = (double *) buf2.ptr,
 *ptr3 = (double *) buf3.ptr;
 for (size_t idx = 0; idx < buf1.shape[0]; idx++)
 ptr3[idx] = ptr1[idx] + ptr2[idx];
 return result;
 }
 
 PYBIND11_MODULE(test, m) {
 m.def("add_arrays", &add_arrays, "Add two NumPy arrays");
 }

array_t里的buf就是一个兼容的接口.

buf中可以得到指针和对应数字的维度信息.

为了方便我们甚至可以使用Eigen当作我们兼容numpy的接口:


#include <pybind11/pybind11.h>
 #include <pybind11/eigen.h> 
 #include <Eigen/LU> 
 // N.B. this would equally work with Eigen-types that are not predefined. For example replacing
 // all occurrences of "Eigen::MatrixXd" with "MatD", with the following definition:
 //
 // typedef Eigen::Matrix<double, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic, Eigen::RowMajor> MatD;
 
 Eigen::MatrixXd inv(const Eigen::MatrixXd &xs)
 {
 return xs.inverse();
 }
 
 double det(const Eigen::MatrixXd &xs)
 {
 return xs.determinant();
 }
 
 namespace py = pybind11;
 
 PYBIND11_MODULE(example,m)
 {
 m.doc() = "pybind11 example plugin";
 
 m.def("inv", &inv);
 
 m.def("det", &det);
 }

更多参考:

https://pybind11.readthedocs.io/en/stable/advanced/pycpp/numpy.html

https://github.com/tdegeus/pybind11_examples

总结

以上所述是小编给大家介绍的pybind11和numpy进行交互的方法,希望对大家有所帮助,如果大家有任何疑问请给我留言,小编会及时回复大家的。在此也非常感谢大家对脚本之家网站的支持! 如果你觉得本文对你有帮助,欢迎转载,烦请注明出处,谢谢!

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